ردیابی و تعیین برخی خصوصیات ویروس برگ قاشقی گیلاس (cherry leaf roll virus) در استان چهارمحال و بختیاری

thesis
abstract

ویروس برگ قاشقی گیلاس(clrv) cherry leaf roll virus از جنس nepovirus و خانواده comoviridae، دارای گسترش جهانی می باشد. این ویروس به طور طبیعی دامنه وسیعی از گیاهان علفی و چوبی را آلوده می کند که مهم ترین آنها متعلق به جنس های betula،fagus ، juglans و prunus می باشند. ویروس برگ قاشقی گیلاس، نارون، شاه توت، تمشک، گردو، زغال اخته، درختان میوه هسته دار و دیگر درختان و بوته ها را آلوده کرده و خسارت شدیدی به آن ها وارد می کند، همچنین در بسیاری از گیاهان علفی مانند ریواس نیز ردیابی شده است. این ویروس در گیلاس و آلبالو باعث ایجاد علایمی مانند لکه های کلروتیک، پیچیدگی برگ،توته، سرخشکیدگی شاخه، ترک خوردگی پوست، صمغ زدگی و زوال می شود. گلدهی و باز شدن برگ ها در درختان گیلاس ممکن است با تاخیر و ضعف همراه باشد. میوه های آلوده دچار سوختگی زودرس شده و قبل از رسیدن متورم می شوند. ویروس برگ قاشقی گیلاس از درختان زیتون استان زنجان گزارش شده است ولی هیچگونه اطلاعاتی از پراکنش و سایر میزبان های این ویروس وخصوصیات مولکولی جدایه های ایرانی آن در دسترس نمی باشد. با توجه به اهمیت ویروس برگ قاشقی گیلاس و نبود اطلاعات در زمینه پراکنش و خصوصیات مولکولی آن انجام تحقیق در این زمینه ضروری به نظر می رسد. به منظور ردیابی و تعیین برخی خصوصیات مولکولی ویروس برگ قاشقی گیلاس، در سال های 1388 و 1389 از برگ درختان هسته دار با علایم ویروسی از باغ های استان های اصفهان و چهارمحال وبختیاری نمونه برداری انجام شد. نتایج حاصل از آزمون double antibody sandwich elisa (das-elisa) با آنتی سرم چندهمسانه ای clrv نشان دهنده آلودگی تعداد قابل توجهی از نمونه ها به این ویروس بود. همچنین آلودگی تعدادی از نمونه ها با آزمون های nested-rt-pcr و ic-nested-rt-pcr با استفاده از جفت آغازگرclrvr clrvf و تکثیر قطعه مورد انتظار bp 286 تایید شد. قطعات تکثیر شده همسانه سازی و تعیین توالی شدند. جدایه های توالی یابی شده شامل جدایه زردآلو چم چنگ (s15)، بادام سامان (s2)، بادام حاشیه زاینده رود (s1) وزردآلو نطنز (s3) بودند. نتایج حاصل از blast توالی ها نشان دهنده ویروسی بودن قطعات تکثیر شده و وجود تشابه بالای آن ها با توالی جدایه های clrv موجود در بانک ژن بود. همچنین مشخص شد قطعه تکثیر شده شامل توالی قسمتی از ناحیه غیر قابل ترجمه آر. ان. ا. دو rna2) (3 utr می باشد. مقایسه توالی نوکلئوتیدی قسمتی از 3 utr جدایه های ایرانی clrv نشان داد که میزان تشابه بین جدایه ها از 5/93% تا 5/97% متغیر می باشد. همردیف سازی چندتایی توالی نوکلئوتیدی جدایه های ایرانی clrv با توالی های موجود در بانک ژن نشان دهنده تشابه بالای بین آنها بود به طوری که بیشترین و کمترین میزان تشابه به ترتیب میان جدایه زردآلوی چم چنگ با جدایه گردو از آلمان با رس شماره aj877146 (%2/98) و جدایه بادام حاشیه زاینده رود با جدایه آقطی سیاه از آلمان با رس شماره aj877138 (%9/86) بدست آمد. رسم درخت تبارزایی بر اساس توالی نوکلئوتیدی قطعه تکثیر شده جدایه های این تحقیق به همراه سایر جدایه های این ویروس از نقاط مختلف جهان، آن ها را در شش گروه فایلوژنی شامل فایلوگروه های a، b، c، d1، d2 وe قرار داد. جدایه های بادام حاشیه زاینده رود (s1) و زردآلو چم چنگ (s15) مورد بررسی در این تحقیق در فیلوگروه d1 و جدایه بادام سامان (s2) در فیلوگروه d2 قرار گرفتند. قرار گرفتن جدایه هایی از مناطق مختلف جغرافیایی در یک گروه نشان دهنده عدم وجود همبستگی بین منطقه جغرافیایی و توالی نوکلئوتیدی جدایه ها بود. با توجه به اهمیت اقتصادی ویروس برگ قاشقی گیلاس و وقوع این ویروس روی درختان هسته دار در استان های اصفهان و چهارمحال و بختیاری، انجام تحقیقات بیشتر روی این ویروس به منظور ردیابی و شناسایی ویروس در سایر میزبان های آن ضروری به نظر می رسد.

First 15 pages

Signup for downloading 15 first pages

Already have an account?login

similar resources

ردیابی و تعیین برخی از خصوصیات بیولوژیکی و مولکولی ویروس زردی چغندرقند (beet yellows virus) در استان های اصفهان و چهارمحال و بختیاری

ویروس زردی چغندرقند (beet yellows virus) یکی از مهمترین ویروس های مولد زردی در چغندرقند است که باعث خسارت شدید اقتصادی در چغندرقند می شود. این ویروس باعث زردی، ضخیم و شکنندگی در برگ های میانی و پایینی می شود. در سال های 1385 و 1386 از مزارع دو استان اصفهان و چهارمـحال و بختیاری نـــمونه برداری انجام گرفــت. نمونه های جمـع آوری شده بـا آزمون das-elisa با آنتی بادی چند همسانه ای byv مورد بررسی قر...

15 صفحه اول

ردیابی و تعیین برخی خصوصیات بیولوژیکی و مولکولی ویروس کوتولگی گوجه prune dwarf virus در درختان میوه هسته دار استان چهارمحال و بختیاری

به منظور بررسی حضور prune dwarf virus در سطح باغات میوه هسته دار استان چهارمحال و بختیاری، طی بهار سال های 90 و 91 نمونه های مشکوک به آلودگی از درختان آلو، بادام، گیلاس، هلو، زردآلو و آلبالو جمع آوری شد. از مجموع 261 نمونه در آزمون das-elisa و با استفاده از آنتی بادی چند همسانه ای ویروس کوتولگی گوجه از شرکت بیوربای سوئیس، آلودگی186 نمونه به اثبات رسید که در بین نمونه های برگی میزان آلودگی نمونه...

ردیابی و تعیین خصوصیات مولکولی ویروس لکه حلقوی بافت مرده هسته دارها prunus necrotic ringspot virus در استان های اصفهان و چهارمحال و بختیاری

درختان میوه هسته دار تحت تاثیر تعداد زیادی از ویروس ها قرار می گیرند که باعث خسارات اقتصادی قابل توجهی می شوند. ویروس لکه حلقوی بافت مرده هسته دارهاprunus necrotic ringspot virus (pnrsv) یکی از شایع-ترین ویروس های هسته دارها می باشد که از جنس ilarvirus و خانوادهbromoviridae بوده و انتشار جهانی دارد. این ویروس در مناطق معتدله جهان روی درختان میوه هسته دار شامل گیلاس، آلبالو، بادام، هلو، زردآلو، ...

15 صفحه اول

Host species-dependent population structure of a pollen-borne plant virus, Cherry leaf roll virus.

Cherry leaf roll virus (CLRV) belongs to the Nepovirus genus within the family Comoviridae. It has a host range which includes a number of wild tree and shrub species. The serological and molecular diversity of CLRV was assessed using a collection of isolates and samples recovered from woody and herbaceous host plants from different geographical origins. Molecular diversity was assessed by sequ...

full text

ردیابی و تعیین برخی خصوصیات ملکولی پلروویروس های آلوده کننده چغندر قند در استان های اصفهان و چهارمحال و بختیاری

. اعضاء جنس polerovirus از خانواده luteoviridae که باعث بروز زردی در چغندرقند می شوند شامل سه گونه beet mild yellowing virus (bmyv)، beet chlorosis virus (bchv) و beet western yellows virus (bwyv) هستند. به منظور ردیابی و تعیین برخی خصوصیات ملکولی پلروویروس های آلوده کننده چغندر قند در دو استان اصفهان و چهارمحال وبختیاری در سال های 1385 و 1386 با بازدید تعدادی از مزارع چغندرقند این دو استان، نم...

15 صفحه اول

Long-distance movement of cherry leaf roll virus in infected tobacco plants.

The long-distance movement of cherry leaf roll virus (CLRV) in tobacco plants was studied using a tissue printing technique with non-isotopic RNA probes. Time-course analysis revealed that CLRV RNA accumulated in the inoculated leaf at an early stage, such as 20 h post-inoculation. The virus accumulation reached a peak at 8-10 days post-inoculation (d.p.i.) and then progressively decreased. The...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده کشاورزی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023